MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 39154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018656	AATC	2	8	13	20	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018656	AC	3	6	46	51	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018656	AATC	2	8	79	86	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018656	TTG	2	6	117	122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018656	AAT	2	6	140	145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018656	TCAA	2	8	172	179	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018656	GTATCT	2	12	198	209	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018656	TCC	2	6	290	295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018656	CT	3	6	327	332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018656	GTA	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018656	CTA	2	6	436	441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018656	TCA	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018656	ATG	2	6	499	504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018656	ATA	2	6	535	540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018656	AAAC	2	8	600	607	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018656	TCA	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018656	TCA	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018656	ACC	2	6	687	692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_018656	AAT	2	6	734	739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018656	ATT	2	6	798	803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018656	ATT	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018656	GGA	2	6	822	827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018656	CTTT	2	8	868	875	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018656	AGA	2	6	905	910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018656	AAT	2	6	920	925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018656	TGA	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018656	ATG	2	6	1138	1143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018656	TTG	2	6	1168	1173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018656	TTG	2	6	1228	1233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018656	GAT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018656	CTG	2	6	1300	1305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018656	GAT	2	6	1335	1340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018656	TGG	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018656	AGC	2	6	1460	1465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018656	TGG	2	6	1490	1495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018656	ACT	2	6	1496	1501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018656	C	6	6	1507	1512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_018656	CAAT	2	8	1516	1523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018656	CCA	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_018656	CTA	2	6	1681	1686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018656	ATC	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018656	AGA	2	6	1751	1756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018656	ACAA	2	8	1767	1774	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018656	TCA	2	6	1785	1790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018656	ATT	2	6	1796	1801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018656	ACA	2	6	1911	1916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018656	ATG	2	6	1918	1923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018656	AAT	2	6	1979	1984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018656	CAT	2	6	2125	2130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018656	TGA	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018656	ACA	2	6	2209	2214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018656	AGCCA	2	10	2224	2233	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_018656	GAAGTT	2	12	2247	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018656	CAT	2	6	2329	2334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018656	TAAT	2	8	2353	2360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018656	AGT	2	6	2366	2371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018656	TGT	2	6	2411	2416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018656	ATT	2	6	2496	2501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018656	GTA	2	6	2544	2549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018656	TGA	2	6	2627	2632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018656	GTG	2	6	2731	2736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018656	ATA	2	6	2794	2799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018656	AAT	2	6	2834	2839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018656	TGA	2	6	2867	2872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018656	AAG	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018656	AGA	2	6	2900	2905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018656	AAAAT	2	10	2916	2925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018656	TAAT	2	8	2960	2967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018656	T	6	6	2978	2983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018656	TAT	2	6	3088	3093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463878
71	NC_018656	TGA	2	6	3105	3110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463878
72	NC_018656	TCT	2	6	3149	3154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463878
73	NC_018656	TCT	2	6	3200	3205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463878
74	NC_018656	T	6	6	3232	3237	0 %	100 %	0 %	0 %	407463878
75	NC_018656	T	7	7	3251	3257	0 %	100 %	0 %	0 %	407463878
76	NC_018656	ATC	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463878
77	NC_018656	T	7	7	3453	3459	0 %	100 %	0 %	0 %	407463878
78	NC_018656	CAA	2	6	3499	3504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463878
79	NC_018656	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463878
80	NC_018656	CAA	2	6	3658	3663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463878
81	NC_018656	AAC	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463878
82	NC_018656	CTT	2	6	3694	3699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463878
83	NC_018656	ATTTC	2	10	3861	3870	20 %	60 %	0 %	20 %	407463878
84	NC_018656	ATTG	2	8	3951	3958	25 %	50 %	25 %	0 %	407463878
85	NC_018656	CTT	4	12	3982	3993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463878
86	NC_018656	CAT	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463878
87	NC_018656	ATT	2	6	4073	4078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463878
88	NC_018656	TAT	2	6	4193	4198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463878
89	NC_018656	ATTT	2	8	4321	4328	25 %	75 %	0 %	0 %	407463878
90	NC_018656	T	6	6	4326	4331	0 %	100 %	0 %	0 %	407463878
91	NC_018656	TCAC	2	8	4459	4466	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018656	AAAT	2	8	4472	4479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018656	ATC	3	9	4527	4535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
94	NC_018656	T	7	7	4562	4568	0 %	100 %	0 %	0 %	407463879
95	NC_018656	AAC	2	6	4584	4589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463879
96	NC_018656	TC	3	6	4604	4609	0 %	50 %	0 %	50 %	407463879
97	NC_018656	TCC	2	6	4614	4619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463879
98	NC_018656	CAT	2	6	4670	4675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
99	NC_018656	GAA	2	6	4682	4687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463879
100	NC_018656	TCT	2	6	4733	4738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463879
101	NC_018656	CAA	2	6	4772	4777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463879
102	NC_018656	T	6	6	4810	4815	0 %	100 %	0 %	0 %	407463879
103	NC_018656	GTT	2	6	4826	4831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463879
104	NC_018656	T	7	7	4873	4879	0 %	100 %	0 %	0 %	407463879
105	NC_018656	TAA	2	6	4896	4901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463879
106	NC_018656	CAT	2	6	4910	4915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
107	NC_018656	T	6	6	4915	4920	0 %	100 %	0 %	0 %	407463879
108	NC_018656	TCA	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
109	NC_018656	TCA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
110	NC_018656	CAT	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
111	NC_018656	TTTGA	2	10	5161	5170	20 %	60 %	20 %	0 %	407463879
112	NC_018656	TCTT	2	8	5182	5189	0 %	75 %	0 %	25 %	407463879
113	NC_018656	GACAT	2	10	5301	5310	40 %	20 %	20 %	20 %	407463879
114	NC_018656	ACA	2	6	5324	5329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018656	A	6	6	5368	5373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018656	GCA	2	6	5561	5566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463880
117	NC_018656	ATCTG	2	10	5584	5593	20 %	40 %	20 %	20 %	407463880
118	NC_018656	GCT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463880
119	NC_018656	T	6	6	5637	5642	0 %	100 %	0 %	0 %	407463880
120	NC_018656	AT	3	6	5757	5762	50 %	50 %	0 %	0 %	407463880
121	NC_018656	A	6	6	5773	5778	100 %	0 %	0 %	0 %	407463880
122	NC_018656	TGA	2	6	5800	5805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463880
123	NC_018656	T	6	6	5808	5813	0 %	100 %	0 %	0 %	407463880
124	NC_018656	TGA	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463880
125	NC_018656	AATC	2	8	5908	5915	50 %	25 %	0 %	25 %	407463880
126	NC_018656	AAGAA	2	10	5971	5980	80 %	0 %	20 %	0 %	407463880
127	NC_018656	TACA	2	8	5986	5993	50 %	25 %	0 %	25 %	407463880
128	NC_018656	ATT	2	6	6005	6010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463880
129	NC_018656	AAAC	2	8	6055	6062	75 %	0 %	0 %	25 %	407463880
130	NC_018656	A	7	7	6076	6082	100 %	0 %	0 %	0 %	407463880
131	NC_018656	AT	3	6	6089	6094	50 %	50 %	0 %	0 %	407463880
132	NC_018656	AAC	2	6	6100	6105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463880
133	NC_018656	CCA	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407463880
134	NC_018656	CAA	2	6	6224	6229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463880
135	NC_018656	ATT	2	6	6238	6243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463880
136	NC_018656	CAT	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463880
137	NC_018656	ATA	2	6	6390	6395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463880
138	NC_018656	TAAT	2	8	6396	6403	50 %	50 %	0 %	0 %	407463880
139	NC_018656	GGAA	2	8	6416	6423	50 %	0 %	50 %	0 %	407463880
140	NC_018656	A	6	6	6425	6430	100 %	0 %	0 %	0 %	407463880
141	NC_018656	A	6	6	6472	6477	100 %	0 %	0 %	0 %	407463881
142	NC_018656	ATCAA	2	10	6497	6506	60 %	20 %	0 %	20 %	407463881
143	NC_018656	AATTC	2	10	6548	6557	40 %	40 %	0 %	20 %	407463881
144	NC_018656	GAT	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463881
145	NC_018656	ATGA	2	8	6676	6683	50 %	25 %	25 %	0 %	407463881
146	NC_018656	AATG	2	8	6775	6782	50 %	25 %	25 %	0 %	407463881
147	NC_018656	A	6	6	6795	6800	100 %	0 %	0 %	0 %	407463881
148	NC_018656	TCC	2	6	6802	6807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463881
149	NC_018656	CTA	2	6	6827	6832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463881
150	NC_018656	A	8	8	6839	6846	100 %	0 %	0 %	0 %	407463881
151	NC_018656	TAAA	2	8	6929	6936	75 %	25 %	0 %	0 %	407463881
152	NC_018656	A	6	6	7004	7009	100 %	0 %	0 %	0 %	407463881
153	NC_018656	GAA	2	6	7083	7088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463881
154	NC_018656	ATT	2	6	7107	7112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463881
155	NC_018656	TGA	2	6	7122	7127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463881
156	NC_018656	TCAAAA	2	12	7168	7179	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407463881
157	NC_018656	AAT	2	6	7188	7193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463881
158	NC_018656	CTT	2	6	7220	7225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463881
159	NC_018656	A	6	6	7229	7234	100 %	0 %	0 %	0 %	407463881
160	NC_018656	TGA	2	6	7239	7244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463881
161	NC_018656	TGA	2	6	7407	7412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463881
162	NC_018656	A	6	6	7455	7460	100 %	0 %	0 %	0 %	407463881
163	NC_018656	A	6	6	7487	7492	100 %	0 %	0 %	0 %	407463881
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166	NC_018656	CTAG	2	8	7537	7544	25 %	25 %	25 %	25 %	407463881
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172	NC_018656	AC	3	6	7777	7782	50 %	0 %	0 %	50 %	407463882
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177	NC_018656	GGA	2	6	7893	7898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407463882
178	NC_018656	CAA	2	6	7899	7904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463882
179	NC_018656	ATC	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463882
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181	NC_018656	CTTT	2	8	7999	8006	0 %	75 %	0 %	25 %	407463882
182	NC_018656	GCA	2	6	8028	8033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463882
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188	NC_018656	AAT	2	6	8315	8320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
189	NC_018656	AATT	2	8	8345	8352	50 %	50 %	0 %	0 %	407463882
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197	NC_018656	ATA	2	6	8695	8700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
198	NC_018656	AGC	2	6	8762	8767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463882
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200	NC_018656	TTC	2	6	9000	9005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463882
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209	NC_018656	TAT	2	6	9654	9659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463882
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233	NC_018656	A	7	7	10519	10525	100 %	0 %	0 %	0 %	407463883
234	NC_018656	ATT	2	6	10593	10598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463883
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236	NC_018656	A	7	7	10618	10624	100 %	0 %	0 %	0 %	407463883
237	NC_018656	ATA	2	6	10669	10674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463883
238	NC_018656	ATT	2	6	10902	10907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463883
239	NC_018656	A	8	8	10915	10922	100 %	0 %	0 %	0 %	407463883
240	NC_018656	TGAT	2	8	10998	11005	25 %	50 %	25 %	0 %	407463883
241	NC_018656	TAA	2	6	11008	11013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_018656	GAA	3	9	11038	11046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463884
243	NC_018656	TTG	2	6	11056	11061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463884
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247	NC_018656	GTA	2	6	11189	11194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463884
248	NC_018656	AAT	2	6	11244	11249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463884
249	NC_018656	TCA	2	6	11254	11259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463884
250	NC_018656	A	6	6	11271	11276	100 %	0 %	0 %	0 %	407463884
251	NC_018656	ATT	2	6	11278	11283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463884
252	NC_018656	TCC	2	6	11295	11300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463884
253	NC_018656	TTC	2	6	11309	11314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463884
254	NC_018656	ACA	2	6	11334	11339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463884
255	NC_018656	A	6	6	11372	11377	100 %	0 %	0 %	0 %	407463884
256	NC_018656	AAC	2	6	11417	11422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463884
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258	NC_018656	TCT	2	6	11512	11517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463884
259	NC_018656	AAT	2	6	11530	11535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463884
260	NC_018656	AAATC	2	10	11545	11554	60 %	20 %	0 %	20 %	407463884
261	NC_018656	A	6	6	11589	11594	100 %	0 %	0 %	0 %	407463884
262	NC_018656	AAT	2	6	11644	11649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463884
263	NC_018656	CAA	2	6	11736	11741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463884
264	NC_018656	AATTAA	2	12	11829	11840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463884
265	NC_018656	GAT	2	6	11917	11922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463884
266	NC_018656	ATT	2	6	11930	11935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463884
267	NC_018656	ACTAA	2	10	12056	12065	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
268	NC_018656	AGA	2	6	12074	12079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
269	NC_018656	GAT	3	9	12166	12174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463885
270	NC_018656	GTC	2	6	12261	12266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463885
271	NC_018656	AAT	2	6	12303	12308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_018656	TTA	2	6	12383	12388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_018656	AAT	2	6	12448	12453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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